解:$ (1) a^2-3a + 1=a^2-3a+\frac {9}{4}-\frac {9}{4}+1$
$=(a-\frac {3}{2})^2-\frac {5}{4}$
$=(a-\frac {3}{2}+\frac {\sqrt {5}}{2})(a-\frac {3}{2}-\frac {\sqrt {5}}{2}),$
∵$(a-\frac {3}{2})^2≥0,$
∴$a^2-3a + 1$的最小值是$-\frac {5}{4}$
$(2) a^4+4=a^4+4a^2+4 - 4a^2$
$=(a^2+2)^2-4a^2$
$=(a^2+2 + 2a)(a^2+2 - 2a)$