解:$(1)$将$A(3,0)$代入$y=-x^2+2x+m,$得
$ 0=-3^2+2×3+m$
$ $解得$m=3$
$ (2)$由$(1)$得函数解析式为$y=-x^2+2x+3,$
令$y=0,$则$-x^2+2x+3=0$
$ $即$x^2-2x-3=0,$因式分解得$(x-3)(x+1)=0$
$ $解得$x_{1}=3,$$x_{2}=-1$
$ $所以点$B$的坐标为$(-1, 0)$
$ (3) $由$S_{\triangle ABD}=S_{\triangle ABC},$$AB$为公共底,
可知点$C、$$D$到直线$AB$的距离相等。
$ $令$x=0,$得$y=3,$即$C(0,3),$则点$D$的纵坐标为$3$或$-3。$
$ ①$当$y=3$时,$-x^2+2x+3=3$
$ $整理得$-x^2+2x=0,$解得$x_{1}=0($与$C$重合,舍去),$x_{2}=2$
$ $故$D_{1}(2, 3)$
$ ②$当$y=-3$时,$-x^2+2x+3=-3$
$ $整理得$x^2-2x-6=0,$
由求根公式得$x=\frac {2\pm \sqrt {(-2)^2-4×1×(-6)}}{2×1}=1\pm \sqrt {7}$
$ $故$D_{2}(1+\sqrt {7}, -3),$$D_{3}(1-\sqrt {7}, -3)$
综上,点$D$的坐标为$(2,3)、$$(1+\sqrt {7}, -3)、$$(1-\sqrt {7}, -3)$