解:
(1)设小明买了$x$支铅笔,$y$支彩笔,
根据题意,得$\begin{cases}2+x+y+2+1=8,\\6+1.5x+4y+9+3.5×1=28\end{cases}$
解得$\begin{cases}x=1,\\y=2\end{cases}$
答:小明买了1支铅笔,2支彩笔.
(2)设购买$m$本笔记本,$n$支铅笔,
根据题意,得$4.5m+1.5n=15,$所以$n=10-3m.$
因为$m,$$n$均为正整数,
所以$\begin{cases}m=1,\\n=7\end{cases}$或$\begin{cases}m=2,\\n=4\end{cases}$或$\begin{cases}m=3,\\n=1\end{cases}$
所以共有3种购买方案,
方案1:购买1本笔记本,7支铅笔;
方案2:购买2本笔记本,4支铅笔;
方案3:购买3本笔记本,1支铅笔.
(3)方案1商家盈利最多.理由如下:
方案1商家可盈利$(4.5-4)×1+(1.5-1.2)×7=2.6$(元);
方案2商家可盈利$(4.5-4)×2+(1.5-1.2)×4=2.2$(元);
方案3商家可盈利$(4.5-4)×3+(1.5-1.2)×1=1.8$(元).
因为$2.6>2.2>1.8,$所以方案1商家盈利最多.