解:$(1)$∵点$A$,$B$在函数$y=\frac {1}{4}x²$的图象上
$A$,$B $的横坐标分别为$-2$,$4$
∴$A$的坐标为$(-2$,$1)$,$B$的坐标为$(4$,$4)$
设直线$AB$的函数表达式为$y=kx+b$
∴$\begin {cases}{-2k+b=1}\\{4k+b=4}\end {cases}$,解得$\begin {cases}{k=\frac {1}{2}}\\{b=2}\end {cases}$
∴直线$AB$的函数表达式为$y=\frac 12x+2$
$(2)$在函数$y=\frac {1}{2}x+2$中,令$x=0$,得$y=2$
∴$C$的坐标为$(0$,$2)$
∴$OC=2$
∴$S_{△AOB}=S_{△AOC}+S_{△BOC}$
$=\frac {1}{2}×2×2+\frac {1}{2}×2×4=6$