解:$(1)$∵抛物线$y=ax²-2ax-3+2a²$
$=a(x-1)²+ 2a²-a-3$
∴抛物线的对称轴为直线$x=1$
$(2)$∵抛物线的顶点在$x$轴上
∴$2a²-a-3=0$
解得$a=\frac {3}{2}$或$a=-1$
∴抛物线的解析式为$y=\frac {3}{2}x²-3x+\frac {3}{2}$
或$y=-x²+2x-1$
$(3)$抛物线的对称轴为$x=1$,$Q(3$,$y_{2})$关于
直线$x=1$的对称点的坐标为$(-1$,$y_{2})$
分情况讨论:$①$当$a>0$时,要使$y_{1}<y_{2}$
则$-1<m<3$
$②$当$a<0$时,要使$y_{1}<y_{2}$
则$m<-1$或$m>3$