解:$(1)$∵$D(4$,$3)$在抛物线$y=ax²-4ax-12a$上
∴$3=16a-16a-12a$
解得$a=-\frac {1}{4}$
∴抛物线的解析式为$y=-\frac 14x²+x+3$
$(2)$当$y=0$时,$0=-\frac 14x^2+x+3$
解得$x_{1}=-2$,$x_{2}=6$
∴$A(-2$,$0)$,$B(6$,$0)$
设直线$AD$的解析式为$y=kx+b(k≠0)$
∵$A(-2$,$0)$,$D(4$,$3)$
∴$\begin {cases}{-2k+b=0}\\{4k+b=3}\end {cases}$,解得$\begin {cases}{k=\frac {1}{2}}\\{b=1}\end {cases}$
∴直线$AD$的解析式为$y=\frac 12x+1$
如图,过点$P $作$PK//y$轴交$AD$于点$K$
设$P(m$,$-\frac {1}{4}m²+m+3)$,则$K(m$,$\frac {1}{2}m+1)$
∵$S_{△PAD}=\frac {1}{2} · (x_D-x_A) · PK=3PK$
∴$PK$的值最大时,$△PAD$的面积最大
∵$PK=-\frac {1}{4}m²+m+3-\frac {1}{2}m-1$
$=-\frac {1}{4}m²+m+2=-\frac {1}{4}(m-1)²+\frac {9}{4}$
∵$-\frac {1}{4}<0$
∴$m=1$时,$PK$的值最大,最大值为$\frac {9}{4}$
此时$△PAD$的面积为$\frac {27}{4}$,$P(1$,$\frac {15}{4})$
$(3)$过$A$作$AT⊥AD$,且$AT=AD$,则$T(-5$,$6)$
设$DT$交$y$轴于点$Q$,则$∠ADQ=45°$
∵$D(4$,$3)$
∴直线$DT$的解析式为$y=-\frac 13x+\frac {13}{3}$
∴$Q(0$,$\frac {13}{3})$
作点$T$关于$AD$的对称点$T'(1$,$-6)$
则直线$DT'$的解析式为$y=3x-9$
设直线$DT'$交$y$轴于点$Q'$
则$∠ADQ'=45°$
∴$Q'(0$,$-9)$
综上,满足条件的点$Q $的坐标为$(0$,$\frac {13}{3})$或$(0$,$-9)$