解:$(1) $由质能方程$E=mc^2,$
代入$m=0.003$千克,$c=3×10^8$米$/$秒:
$ E=0.003×(3×10^8)^2$
$ =0.003×9×10^{16}$
$ =2.7×10^{14}($焦耳$)$
答:该能量为$2.7×10^{14}$焦耳。
$ (2) $所求汽油质量为:
$ (2.7×10^{14})\div (4.5×10^7)=6×10^6($千克$)$
答:等同于$6×10^6$千克汽油完全燃烧产生的能量。
$ (3) $汽油体积为:
$ 6×10^6\div 0.75=8×10^6($升$)$
$ $因为$1$升$=1$立方分米,所以体积为$8×10^6$立方分米。
$ $设正方体容器棱长为$a$分米,则$a^3=8×10^6,$
$ a^3=(2×10^2)^3,$解得$a=200$
答:该正方体容器的棱长为$200$分米。