解:$(2)$设按$A$方式裁剪$x$块,$B$方式裁剪$y$块,$C$方式裁剪$z$块,
$x+y+z=n。$
$ $圆形底面总数为$6x+9z,$侧面总数为$x+3y,$
根据配套关系$6x+9z=2(x+3y),$整理得:
$ 4x+9z=6y,$
$ $将$y=n-x-z$代入得:
$ 4x+9z=6(n-x-z),$
$ 10x+15z=6n,$
$ 2x+3z=\frac {6n}{5}。$
∵$x,z,n$为正整数,且$40≤ n≤50,$
∴$n$是$5$的倍数,
$ $当$n=40、$$45、$$50$时,方程有正整数解,
∴$n$的值为$40$或$45$或$50。$