解:$ (1) $证明: ∵四边形$ABCD$是正方形,
∴$AB=CB,∠ ABD=∠ CBD$。
$ $又$BE=BE$,
∴$△ ABE≌△ CBE(\mathrm {SAS})$。
$ (2) $∵四边形$ABCD$是正方形,
∴$∠ BAD=90°,∠ ADB=45°$。
∵$DE=DA$,
∴$∠ DAE=∠ DEA$。
∵$∠ DAE+∠ DEA+∠ ADE=180°$,
∴$∠ DAE=∠ DEA=67.5°$,
∴$∠ BAE=∠ BAD-∠ DAE=90°-67.5°=22.5°$。