解:$ (1) $设$A$种柑橘礼盒每件的售价为$a$元,
则$B$种柑橘礼盒每件的售价为$(a+20)$元,
根据题意,得$\frac {2000}{a}=\frac {2500}{a+20}$,
解得$a=80$,
∴$a+20=100$。
$ $故$A$,$B$两种柑橘礼盒每件的售价分别为$80$元,$100$元。
$ (2) $设售出$A$种柑橘礼盒$x$盒,
则售出$B$种柑橘礼盒$(1000-x)$盒,
根据题意,得
$ \begin {cases} x≤ 1.5(1000-x) \\50x+60(1000-x)≤ 54050 \end {cases} $
$ $解得$595≤ x≤600$。
$ $设收益为$y$元,得
$y=(80-50)x+(100-60)(1000-x)=-10x+40000$。
∵$-10<0$,
∴$y$随$x$的增大而减小,
∴当$x=595$时,$y$取得最大值,
最大值为$-10×595+40000=34050$元,
此时售出$B$种柑橘礼盒$1000-595=405$盒。
故要使农户收益最大,销售方案为售出$A$种
柑橘礼盒$595$盒,$B$种柑橘礼盒$405$盒,最大
收益为$34050$元。