【分析】
首先先抓取题干的核心关键词“从根本上改变”，先回忆航天育种的相关原理：航天育种是将种子送入太空，利用太空特殊的辐射、微重力等环境诱导种子发生变异。接下来我们要明确：生物的形态结构、生理功能、生活习性都属于外在表现出的性状，性状是由遗传物质决定的，“根本上”的改变一定指向决定性状的内在本质，因此可以直接排除属于性状层面的干扰选项，锁定遗传物质这个核心答案。
【解析】
航天育种属于诱变育种的一种，太空环境中的宇宙射线、微重力等特殊条件，会诱导作物种子的遗传物质发生变异，产生可遗传的变异：
选项A：形态结构是生物外在的性状表现，是遗传物质改变后呈现出的外在特征，不是根本层面的改变对象，不符合题意；
选项B：生理功能属于生物功能层面的性状表现，由遗传物质控制，并非育种过程中从根本上改变的内容，不符合题意；
选项C：生活习性是生物长期形成的行为特性，属于性状的范畴，不是根本改变的对象，不符合题意；
选项D：航天育种的本质就是通过特殊太空环境诱导种子的遗传物质发生变异，从根本上改变了种子的遗传物质，符合题意。
【答案】
D
【知识点】
诱变育种原理
遗传物质决定性状
【点评】
本题属于基础概念题，核心考点是区分生物的外在性状表现和决定性状的内在本质，只要抓住题干中“从根本上”的关键限定词，就能快速排除属于性状层面的干扰选项，易错点是误将外观性状的变化当成育种的根本改变对象，明确可遗传变异的核心是遗传物质发生改变即可轻松解题。
【难度系数】
0.9

【分析】
首先先提取题干的模拟实验设定：长绳被设定为代表1个完整的DNA分子，我们要判断这个DNA分子上的不同颜色标记的片段对应的生物学结构。解题的核心思路是先回忆染色体、DNA、基因、蛋白质几者的从属和组成关系，再结合题干的前提逐一排除不符合的选项：首先，长绳本身已经是DNA，它上面的片段不可能是比它整体层级更高的结构，也不可能是和DNA并列的组成物质，最后匹配到“DNA上的功能片段”对应的概念即可。
【解析】
解：首先明确题干的模拟对应规则：整根长绳代表1个完整的DNA分子，不同颜色标记的是该DNA分子上的不同区段。
对选项逐一分析：
A. 基因是有遗传效应的DNA片段，1个DNA分子上可以分布多个不同的基因，完全符合“DNA上不同片段”的设定，该选项正确。
B. 蛋白质是和DNA共同组成染色体的物质，不属于DNA分子自身的片段，该选项错误。
C. 整根长绳已经代表一个完整的DNA，其上面的局部片段不可能再代表DNA，逻辑矛盾，该选项错误。
D. 染色体主要由DNA和蛋白质组成，未复制的1条染色体刚好对应题干里的这1个DNA分子，不可能是DNA上的局部小片段，该选项错误。
【答案】
A
【知识点】
基因是DNA片段，染色体DNA基因关系
【点评】
本题通过简易的模拟实验考察核心概念辨析，解题关键是先锚定题干给出的模拟对应前提，再结合几类物质的包含关系逐一排除错误选项，侧重考察对基础概念的理解，难度较低。
【难度系数】
0.9