解: (1)设修建1个$A$种光伏车棚需投资$x$万元,修建1个$B$种光伏车棚需投资$y$万元,根据题意,得$\begin{cases}2x + y = 8\\5x + 3y = 21\end{cases},$解得$\begin{cases}x = 3\\y = 2\end{cases}。$答:修建1个$A$种光伏车棚需投资3万元,修建1个$B$种光伏车棚需投资2万元。
(2)设修建$A$种光伏车棚$m$个,则修建$B$种光伏车棚$(20 - m)$个,修建$A$种和$B$种光伏车棚共投资$W$万元,根据题意,得$m\geq2(20 - m),$解得$m\geq\frac{40}{3},$$W = 3m + 2(20 - m)=m + 40,$$\because1>0,$$\therefore W$随$m$的增大而增大,$\therefore$当$m = 14$时,$W$取得最小值,此时$W = 14 + 40 = 54$(万元)。答:修建14个$A$种光伏车棚时,投资总额最少,最少投资总额为54万元。