证明:$(1)$∵四边形$ABCD$是平行四边形,
∴$AB=CD,$
∵$BE=CF,$
∴$BE+EF=CF+EF,$即$BF=CE。$
在$△ABF $和$△DCE$中,
$\begin {cases}{AB=CD}\\{AF=DE}\\{BF=CE}\end {cases}$
∴$△ABF≌△DCE(\mathrm {SSS})。$
$(2)$证明:由$(1)$知$△ABF≌△DCE,$
∴$∠B=∠C。$
∵四边形$ABCD$是平行四边形,
∴$∠B+∠C=180°,$
∴$∠B=∠C=90°,$
∴四边形$ABCD$是矩形。