解:$(1)y=-\frac {1}{4}x^2-2x-3$
$ =-\frac {1}{4}(x^2+8x)-3$
$ =-\frac {1}{4}(x^2+8x+16-16)-3$
$ =-\frac {1}{4}(x+4)^2+4-3$
$ =-\frac {1}{4}(x+4)^2+1$
$ (2) $画图如图,顶点坐标是$(-4,1),$对称轴是过点$(-4,1)$且平行于$y$轴的直线。
$ (3) $因为$a=-\frac {1}{4}<0,$函数开口向下,
$ $当$x=-4$时,$y$有最大值,最大值是$1。$