$ (1) $证明:∵四边形$ABCD$是平行四边形,
∴$∠ ABC=∠ ADC,$$AB=CD,$$BC=DA。$
∵$△ BCE$和$△ CDF $都是等边三角形,
∴$BE=BC,$$FD=CD,$$∠ EBC=∠ CDF=60°,$
∴$AB=FD,$$BE=DA,$
$ ∠ ABC+∠ EBC=∠ ADC+∠ CDF,$
即$∠ ABE=∠ FDA。$
$ $在$△ ABE$和$△ FDA$中,
$ \begin {cases}AB=FD, \\∠ ABE=∠ FDA, \\BE=DA,\end {cases}$
∴$△ ABE≌△ FDA(\mathrm {SAS}),$
∴$AE=FA$
$ (2) $解:由$(1),$得$△ ABE≌△ FDA,$
∴$∠ AEB=∠ FAD。$
∵四边形$ABCD$是平行四边形,$∠ BCD=120°,$
∴$∠ BAD=∠ BCD=120°,$$AB// CD,$
∴$∠ ABF=180°-∠ BCD=180°-120°=60°,$
∴$∠ ABE=∠ ABF+∠ EBC=60°+60°=120°,$
∴$∠ AEB+∠ BAE=180°-∠ ABE=180°-120°=60°,$
∴$∠ FAD+∠ BAE=60°,$
∴$∠ EAF=∠ BAD-(∠ FAD+∠ BAE)=120°-60°=60°$