$ (1) $证明:∵四边形$ABCD$是平行四边形,
∴$AD// BC,$$AB=CD,$$AD=BC,$$∠ B=∠ D.$
∵$AF=CE,$
∴$AD-AF=BC-CE,$即$DF=BE.$
$ $在$△ ABE$和$△ CDF_{中},$
$ \begin {cases}AB=CD, \\∠ B=∠ D, \\BE=DF,\end {cases}$
∴$△ ABE≌△ CDF(\mathrm {SAS}).$
$ (2) $解:当$E$是$BC$的中点时,四边形$ABEF $是平行四边形$.$
∵$E$是$BC$的中点,
∴$BE=EC.$
又∵$AF=EC,$
∴$BE=AF.$
∵$BE// AF,$
∴四边形$ABEF $是平行四边形$.$