解:$ (2)$当$x>0$时,$y=x+\frac {4}{x+1}=x+1+\frac {4}{x+1}-1≥2\sqrt {(x+1)·\frac {4}{x+1}}-1=2×2-1=3,$
$ $当且仅当$x+1=\frac {4}{x+1},$即$x+1=2,$即$x=1$时取等号,
∴当$x=1$时,函数$y=x+\frac {4}{x+1}$有最小值,最小值为$3。$
$ (3)$设$S_{△ BOC}=x,$
由题意可知,$S_{△ BOC}:S_{△ COD}=S_{△ AOB}:S_{△ AOD},$
则$x:9=4:S_{△ AOD},$∴$S_{△ AOD}=\frac {36}{x}。$
∴$S_{四边形ABCD}=4+9+x+\frac {36}{x}≥13+2\sqrt {x·\frac {36}{x}}=25,$当且
仅当$x=6$时等号成立。
∴四边形$ABCD$面积的最小值为$25。$