解:$(1)$设甲队平均每天修复公路$x$千米,则乙队平均每天修复公路$(x+3)$千米,
根据题意得:
$ \frac {60}{x}=\frac {90}{x+3}$
$ $解得$x=6$,经检验符合题意,$x+3=9$。
答:甲队平均每天修复公路$6$千米,乙队平均每天修复公路$9$千米。
$ (2)$设甲队工作时间为$m_{天}$,则乙队工作时间为$(15-m)$天,总修复长度为$w$千米,
$ w=6m+9(15-m)=-3m+135$
$ $由题意得$m≥2(15-m)$,解得$m≥10$。
$ $因为$-3<0$,$w$随$m $增大而减小,当$m=10$时$w$取最大值$105$。
答:两队最多能修复公路$105$千米。